ينظم المركز مؤتمرات ومحاضرات وندوات علمية بشكلٍ منتظم، ويشرف عليها مختصون في المجالات المعنية. وتتضمن لائحة الفعاليات الدورية للمركز خمسة مؤتمرات رئيسة، هي: مؤتمر العلوم الاجتماعية والإنسانية (عُقدت منه ستّ دورات سنوية، ثم أصبح كلّ سنتين)، والمؤتمر السنوي لقضايا التحوّل الديمقراطي، ومنتدى دراسات الخليج والجزيرة العربية، والمؤتمر السنوي للدراسات التاريخية، والمؤتمر السنوي عن العرب والعالم وتتضمن اللائحة أيضًا سلسلة مؤتمرات وندوات وورشات عمل غير دورية متعددة الموضوعات
